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Elle est
considérée comme zone de Protection Spéciale pour les
oiseaux, et possède un grand intérêt géomorphologique.
Dans la Foz de Arbayún se trouve l’une des limites biogéographiques
entre les types de végétation atlantico-pyrénéenne et méditerranéenne.
Les forêts de hêtres et de pins rouges prédominent, avec
des zones de sapins pyrénéens, les plus méridionaux de
cette espèce sur la péninsule.
À l’intérieur, dans les zones les plus humides de la
gorge, on trouve des forêts de berge et des communautés
riches en tilleuls, frênes, érables, sorbiers, noisetiers
et ormes. On peut remarquer quelques espèces exclusives de
cette région dans les fissures rocheuses, comme la "Saxifraga
longifolia", "Sarcocapnos enneaphylla",
"Saponaria glutinosa" et la "Petrocoptis
hispanica". Au début de la gorge, et au plus profond,
poussent des forêts de chênes pubescents, associées à
quelques zones peuplées de chênes faginés et chênes
kermes.
Quant à la
faune, on peut voir dans la gorge d’Arbayún quelques-unes
des plus grandes peuplades d’oiseaux rapaces du
contiennent européen, et parmi celle-ci, la principale
colonie de vautours fauves de Navarre, et la seconde, en
nombre, de la péninsule ibérique et du reste de l’Europe.
On peut aussi avoir la chance d’y voir des vautours barbus,
vautours percnoptères, Circaètes Jean-le-blanc, aigles
royaux et aigles bottés, milans noirs et royaux, aigles
huppés, busards cendrés, busards Saint-Martin, grand-duc
d’Europe, faucon commun, etc.… En ce qui concerne les
mammifères, on trouve, entre autres, chevreuils et
sangliers.
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